Gemi sicili, liman, ölçme, tonilato ve denizcilik belgelerine ilişkin işlemler 492 sayılı Harçlar Kanunundaki özel tarifelere göre harca tabi olabilir.
Gemi sicil işlemleri
Tescil, terkin, ipotek ve mülkiyet değişikliği işlemlerinde harç türü geminin niteliği ve işlem değerine göre değişebilir.
Liman işlemleri
Giriş-çıkış, belge ve liman idaresi işlemlerinde harçla birlikte hizmet bedelleri de bulunabilir; bunlar ayrı hukuki kalemlerdir.
Yabancı bayrak ve uluslararası sefer
Uluslararası anlaşma, karşılıklılık veya Türk Uluslararası Gemi Sicili gibi özel rejimler harç istisnası/indirimi sağlayabilir.